Кафедра лабораторної діагностики біологічних систем

Permanent URI for this collection

https://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/12297

Browse

Browsing Кафедра лабораторної діагностики біологічних систем by Subject "Arabidopsis"

Now showing 1 - 2 of 2
  • Thumbnail Image
    Item
    Изучение роли протеинкиназ СК1 в организации кортикальных микротрубочек корня Arabidopsis thaliana
    (2019) Карпов, П.; Шеремет, Я.; Блюм, Ярослав; Емец, Алла
    Представители подсемейства Казеин киназа 1 ( СК1) отличаются межвидовым консерватизмом и обширным набором субстратов фосфорилирования. Недавно появились доказательства того, что СК1 способны непосредственно фосфорилировать тубулин. Таким образом, СК1 вносят вклад в тубулиновый код и функциональную специализацию микротрубочек. В данной работе мы представляем результаты исследования ответной реакции тубулинового цитоскелета растений на обработку СК1 -специфичным ингибитором 04476. Было показано, что D4 4 7 6 оказывает сильный дозозависимый эффект на рост и морфологию корней Arabidopsis thaliana. Эксперименты на растениях, экспресирующих химерный ген gfp-тар4, доказали взаимосвязь наблюдаемых морфологических реакций с пространственной реорганизацией микротрубочек вызванной избирательным ингибированием протеинкиназ СК1.
  • Thumbnail Image
    Item
    Структурно-биологическая характеристика изотипов СК1-подобных протеинкиназ, непосредственно связанных с регуляцией системы микротрубочек высших растений
    (2020) Карпов, П.; Раевский, А.; Шеремет, Я.; Емец, Алла; Блюм, Ярослав
    Идентифицировано 18 изотипов СК1-подобных протеинкиназ у A. thaliana. Сравнение каталитических доменов протеинкиназ СК1 крысы (a, ft, у 1-3, due) и 18-ти гомологов из A. thaliana подтвердило значительное структурное сходство 13-ти протеинкиназ: CKL1 (CK1S), CKL2, CKL3, CKL4, CKL5, CKL6, CKL7, CKL8, CKL9, CKL10, CKL11, С К Ш и CKL13. Было обнаружено, что СК1 -специфический ингибитор D4476 взаимодействует с KC1D крысы и отобранными растительными гомологами аналогичным АТФ-конкурентным способом. Взаимодействие с лигандом было подтверждено значениями оценочных функций докинга, результатами молекулярной динамики и результатами хемогенного анализа. Известно, что взаимодействие протеинкиназ СК1 с субстратными белками в значительной степени зависит от наличия специфических мотивов, расположенных в С-концевой области. Соответствующие мотивы взаимодействия с ЕВ1 были выявлены в С-концевых областях CKL1 и CKL2. Также была подтверждена роль С-коневого фрагмента CKL6 во взаимодействии с В-тубулином.