Кафедра лабораторної діагностики біологічних систем

Permanent URI for this collection

https://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/12297

Browse

Browsing Кафедра лабораторної діагностики біологічних систем by Subject "Arabidopsis thaliana"

Now showing 1 - 3 of 3
  • Thumbnail Image
    Item
    Ivermectin affects Arabidopsis thaliana microtubules through predicted binding site of β-tubulin
    (2024) Kustovskiy, Yevhen; Karpov, Pavel; Blume, Yaroslav; Yemets, Alla
    The ivermectin is a potent nematocide and insecticide, which has low toxicity for humans and domestic animals, but due to low biotransformation, it can be dangerous for non-target organisms. The recent determination of ivermectin absorption and accumulation in tissues of higher plants and multiple shreds of evidence of its negative impact on plant physiology provide a basis for the search for ivermectin’s molecular targets and mechanisms of action in plant cells. In this research, for the first time, the ivermectin effect on microtubules of Arabidopsis thaliana cells was studied. It was revealed that ivermectin (250 μg mL- 1) disrupts the microtubule network, induces the loss of microtubule orientation, leads to microtubule curvature and shrinkage, and their longitudinal and cross-linked bundling in various cells of A. thaliana primary roots. Further, the previously proposed binding of ivermectin to the β1-tubulin taxane site was developed and confirmed using molecular dynamics simulations of ivermectin complexes with Haemonchus contortus and A. thaliana β1-tubulins. It was predicted that similar to other microtubule stabilizing agents ivermectin binding causes M-loop stabilization in both H. contortus and A. thaliana β-tubulin, which leads to the enhancement of lateral contacts between subunits of adjacent protofilaments preventing microtubule depolymerization.
  • Thumbnail Image
    Item
    Потенційна роль протеїнкіназ SnRK1 у регуляції клітинного поділу Arabidopsis Thaliana
    (2019) Краснопьорова, О.; Буй, Дмитро; Горюнова, І.; Ісаєнков, С.; Карпов, П.; Блюм, Ярослав; Ємець, Алла
    Відомо, що підродина протеїнкіназ SnRKl бере участь у регулюванні вуглеводного обміну та енергетичного балансу. Ці ферменти характеризуються своєю багатофункціональністю та можуть приймати участь в багатьох інших важливих процесах у клітині. В даній роботі вивчаїїи роль протеїнкіназ SnRKl (KIN10 та KIN 11) у регуляції клітинного поділу Arabidopsis thaliana. Для цього використовували мутантні лінії kinlO /kinll A. thaliana (http://arabidopsis.info/), нокаутні по генах KIN 10 та KIN 11. В цих мутантах було зафіксовано низький мітотичний індекс та показано знижений рівень експресії маркерів клітинної проліферації - генів CYCB1;! (циклін В) та рослинного гомолога BRCA1 (Breast Cancer Suppressor Protein). Значно нижчий мітотичний індекс та рівень експресії CYCB1;! і BRCA1 спостерігали саме у мутантах, які були вирощені за умов енергетичного голодування. Також було зафіксовано підвищену експресію CYCB1;1/ BRCA1 та KIN10/KIN11 у суспензійній культурі A. thaliana в порівнянні з інтактними проростками. Такі дані можуть свідчити про можливу роль протеїнкіназ KIN 10/KIN11 у регуляції проліферативної активності.
  • Thumbnail Image
    Item
    Формування аутофагосом та транскрипційна активність генів atg8 у клітинах кореня арабідопсису при розвитку аутофагії за умов мікрогравітації
    (2020) Шадріна, Р.; Горюнова, І.; Ємець, Алла; Блюм, Ярослав
    Проведено морфологічний та цитологічний аналіз проростків коренів Arabidopsis thaliana і досліджено процес індукції аутофагії в їх клітинах за умов мікрогравіатації. Встановлено істотне порушення розвитку коренів проростків і збільшення кількості аутофагосом в епідермальних клітинах перехідної зони кореня на 6-ту добу вирощування за умов кліностатування, а також поступове зменшення їх кількості на 9-ту і 12-ту добу порівняно з контрольними рослинами, що може свідчити про адаптацію до умов зміненої гравітації. Результати транскрипційного аналізу активності генів родини atg8 (atg8a, atg8b, atg8c, atg8d, atg8e, atg8f, atg8g, atg8h та atg8i), залучених до реалізації початкових етапів аутофагії (6—12 діб кліностатування), свідчать про залежний від часу характер змін рівня експресії більшості цих генів. Зокрема, зареєстровано підвищення рівня експресії генів atg8a, atg8c, atg8d на 6-ту добу, поступове їх зниження на 9-ту добу і різке зниження після 12 діб кліностатування порівняно з контролем. Також встановлено значне (порівняно з контролем) підвищення рівня експресії генів atg8e, atg8f та atg8i на 6-, 9- та 12-ту добу. Отримані результати дають підставу стверджувати, що досліджувані гени atg8 є специфічними для реалізації початкових етапів аутофагії, індукованої мікрогравітацією.