Methylation pattern of tumor-suppressor gene promoters as putative noninvasive diagnostic markers for prostate cancer
Loading...
Date
2021
Authors
Mankovska, Oksana
Korsakova, A.
Cherniavskyi, K.
Kononenko, O.
Stakhovskyy, E.
Bondarenko, Yu.
Kashuba, Volodymyr
Gerashchenko, G.
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Aim. To assess the rate of promoter methylation of putative TSGs for PCa in tumor tissue and
in urine of PCa patients for better understanding of regulation of gene expression upon the
PCa development and to evaluate the possibility to use the data on TSGs’ methylation for the
development of noninvasive PCa markers. Methods. A quantitative methyl-specific PCR
(qMSP) was used for the analysis of a methylation rate in prostate tissues and cell lines, and
an ordinary MSP was performed for the study of urine samples. Results. We found that the
RASSF1A promoter demonstrated a higher methylation rate in the TMPRSS2:ERG fusion
positive PCa. The methylation of NKX3.1, PTEN and RASSF1A in DNA from urine was more
common for cancer patients than for healthy donors. The promoters of CDH1 and GDF15
were methylated more frequently in PCa patients, than in patients with inflammatory disease.
Conclusions. The abovementioned five genes can form a panel for early non-invasive detection of PCa. This set can be combined with the detection of the TMPRSS2:ERG fusion transcript. More work should be done to understand the molecular mechanisms explaining the
functional role of promoter methylation of the selected genes.
Мета. Оцінити метилювання промоторів низки потенційних генів-супресорів росту РПЗ у пухлинній тканині та сечі хворих на РПЗ для кращого розуміння регуляції експресії генів при розвитку РПЗ та оцінити можливість використання метилювання генів-онкосупресорів як неінвазивних маркерів РПЗ. Методи. Для кількісного аналізу метилювання промоторів досліджуваних генів використовували кількісну метил-специфічну ПЛР (qMSP), для виявлення метилювання у зразках сечі проводили метилспецифічну ПЛР, результати якої перевіряли за допомогою електрофорезу. Результати. Рівень метилювання промотора RASSF1A є значно вищим у TMPRSS2: ERG позитивних аденокарциномах. Метилювання промоторів NKX3.1, PTEN та RASSF1A є частою подією для пацієнтів із РПЗ у порівнянні з умовно здоровими особами. Метилювання CDH1 та GDF15 часто зустрічається у пацієнтів з РПЗ, у порівнянні із пацієнтами із запаленням. Висновки. Вищезазначені п’ять генів можуть утворювати панель для раннього неінвазивного виявлення РПЗ. Цей набір можна поєднати з виявленням TMPRSS2:ERG транскрипту. Потрібно провести більше роботи, щоб зрозуміти молекулярні механізми, що пояснюють функціональну роль метилювання промотору вибраних генів.
Цель. Оценить метилирование промоторов ряда потенциальных генов-супрессоров роста РПЖ в опухолевой ткани и в моче пациентов с РПЖ для лучшего понимания регуляции экспрессии генов при развитии РПЖ и оценить возможность использования метилирования генов онкосупрессоров в качестве неинвазивных маркеров РПЖ. Методы. Для количественного анализа метиллирования промоторов исследуемых генов использовали количественную метилспецифичную ПЦР (qMSP), для выявления метилирования в образцах мочи проводили метилспецифическую ПЦР, результаты которой проверяли с помощью электрофореза. Результаты. Уровень метилирования промотора RASSF1A значительно выше в TMPRSS2: ERG положительных аденокарциномах. Метилирования промоторов NKX3.1, PTEN и RASSF1A является частым событием для пациентов с РПЖ по сравнению с условно здоровыми лицами. Метилирования CDH1 и GDF15 часто встречается у пациентов с РПЖ, по сравнению с пациентами с воспалением. Выводы. Вышеупомянутые пять генов могут образовать панель для раннего неинвазивного выявления РПЖ. Этот набор можно совместить с выявлением TMPRSS2: ERG транскрипта. Нужно провести больше работы, чтобы понять молекулярные механизмы, объясняющие функциональную роль метилирования промотора выбранных генов.
Мета. Оцінити метилювання промоторів низки потенційних генів-супресорів росту РПЗ у пухлинній тканині та сечі хворих на РПЗ для кращого розуміння регуляції експресії генів при розвитку РПЗ та оцінити можливість використання метилювання генів-онкосупресорів як неінвазивних маркерів РПЗ. Методи. Для кількісного аналізу метилювання промоторів досліджуваних генів використовували кількісну метил-специфічну ПЛР (qMSP), для виявлення метилювання у зразках сечі проводили метилспецифічну ПЛР, результати якої перевіряли за допомогою електрофорезу. Результати. Рівень метилювання промотора RASSF1A є значно вищим у TMPRSS2: ERG позитивних аденокарциномах. Метилювання промоторів NKX3.1, PTEN та RASSF1A є частою подією для пацієнтів із РПЗ у порівнянні з умовно здоровими особами. Метилювання CDH1 та GDF15 часто зустрічається у пацієнтів з РПЗ, у порівнянні із пацієнтами із запаленням. Висновки. Вищезазначені п’ять генів можуть утворювати панель для раннього неінвазивного виявлення РПЗ. Цей набір можна поєднати з виявленням TMPRSS2:ERG транскрипту. Потрібно провести більше роботи, щоб зрозуміти молекулярні механізми, що пояснюють функціональну роль метилювання промотору вибраних генів.
Цель. Оценить метилирование промоторов ряда потенциальных генов-супрессоров роста РПЖ в опухолевой ткани и в моче пациентов с РПЖ для лучшего понимания регуляции экспрессии генов при развитии РПЖ и оценить возможность использования метилирования генов онкосупрессоров в качестве неинвазивных маркеров РПЖ. Методы. Для количественного анализа метиллирования промоторов исследуемых генов использовали количественную метилспецифичную ПЦР (qMSP), для выявления метилирования в образцах мочи проводили метилспецифическую ПЦР, результаты которой проверяли с помощью электрофореза. Результаты. Уровень метилирования промотора RASSF1A значительно выше в TMPRSS2: ERG положительных аденокарциномах. Метилирования промоторов NKX3.1, PTEN и RASSF1A является частым событием для пациентов с РПЖ по сравнению с условно здоровыми лицами. Метилирования CDH1 и GDF15 часто встречается у пациентов с РПЖ, по сравнению с пациентами с воспалением. Выводы. Вышеупомянутые пять генов могут образовать панель для раннего неинвазивного выявления РПЖ. Этот набор можно совместить с выявлением TMPRSS2: ERG транскрипта. Нужно провести больше работы, чтобы понять молекулярные механизмы, объясняющие функциональную роль метилирования промотора выбранных генов.
Description
Keywords
gene promoter methylation, tumor suppressor genes, noninvasive diagnostics, prostate cancer, article, метилювання промотора гена, гени-онкосупресори, неінвазивна діагностика, рак передміхурової залози, метилирования промотора гена, гены-онкосупрессоры, неинвазивная диагностика, рак предстательной железы
Citation
Methylation pattern of tumor-suppressor gene promoters as putative noninvasive diagnostic markers for prostate cancer / O. S. Mankovska, A. S. Korsakova, K. R. Cherniavskyi, O. A. Kononenko, E. O. Stakhovskyy, Yu. M. Bondarenko, V. I. Kashuba, G. V. Gerashchenko // Biopolymers and Cell. - 2021. - Vol. 37, N 1. - P. 23-32.