Browse
Recent Submissions
Item Antibacterial properties of composite materials based on metal/metal-oxide nanoparticles, nanosilica and polylactid acid(2025) Bespalko, Oleksandr; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Pomastowskі, PawełThe global rise in antimicrobial resistance necessitates the development of alternative materials with effective antibacterial properties. This study compares two classes of nanocomposites: silver nanoparticle (AgNP)- and zinc oxide (ZnO)-based systems, both immobilized on silica (SiO₂) and treated with polylactic acid (PLA) to enhance biocompatibility and biodegradability. AgNP-containing composites (SiO₂- Ag and SiO₂-Ag-PLA) exhibited potent, broad-spectrum antibacterial activity, particularly against Gram-negative E. coli and K. pneumoniae, though activity decreased when modified with PLA—likely due to reduced ion release and surface coverage interference.Item Synthesis of Tinidazole-Based Nanocomposites and Evaluation of Their Physicochemical Properties(2025) Avramenko, Viktoriia; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Melnykov, V.; Murlanova, Tetiana; Pomastowskі, Paweł; Smarsly, BerndThe aim of the study was to obtain NCs based on nanosilica capable of improving the properties of tinidazole and increasing the safety of its use.Item Antibacterial properties of silver-containing composite materials based on silica and polylactic acid(2025) Bespalko, Oleksandr; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Pomastowskі, PawełThis study aimed to investigate composite materials containing silver nanoparticles (AgNPs) impregnated on silica (SiO2) and incorporated into a polylactic acid (PLA) matrix.Item Study of guanidine-containing oligomer for desinfectant application(2025) Hodlevskyi, H.; Hudyma, A.; Vakuliuk, Polina; Pryshchepa, Oleksandra; Furtat, Iryna; Vortman, Maryna; Fijalkowski, Pawel; Rafińska, K.; Lemeshko, Valentyna; Murlanova, Tetiana; Smarsly, Bernd; Pomastowskі, Paweł; Shevchenko, V.The purpose of this project is a creation of guanidine containing oligomer, that could be used as a disinfectant against multiresistant microorganisms.Item Physicochemical and antibacterial properties of ornidazole based nanocomposites for medical application(2025) Avramenko, Viktoriia; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Demianenko, Eugeniy; Murlanova, Tetiana; Smarsly, Bernd; Pomastowskі, PawełThis study analyzed nanocomposites with ornidazole – an antimicrobial agent effective against anaerobic bacteria and protozoa.Item Зоологія безхребетних у презентаціях [електронний ресурс] : навчальний посібник(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2025) Пасічник, СергійУ навчальному посібнику розглянуто системи тваринного світу. Розкрито сучасний стан зоологічної науки, її місце серед біологічних дисциплін і значення серед фундаментальних і прикладних біологічних наук. Основний об’єкт – це безхребетні тварини, а саме план будови та рівні організації, життєві цикли розвитку, біологічні особливості, місце в екосистемах, розповсюдження, походження та філогенетичні зв’язки головних таксономічних одиниць, закономірності індивідуального та історичного розвитку. Представлено сучасну систематику безхребетних тварин. Розглянуто специфіку проявів загальнобіологічних законів на прикладі безхребетних тварин, порівняльні анатомо-морфологічні особливості систем органів і головні риси їхньої еволюції, роль у біосфері, житті та господарській діяльності людини. Інформацію подано у формі презентацій (Microsoft PowerPoint). Посібник містить зображення з відкритих джерел. Для студентів закладів вищої освіти, які слухають зоологічні курси, та викладачів практичних курсів із зоології безхребетних.Item Зоологія хордових у презентаціях [електронний ресурс] : навчальний посібник(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2025) Пасічник, Сергій; Пасічник, ТетянаНавчальний посібник охоплює основні питання зоології хордових. Окреслено місце цієї науки серед біологічних дисциплін та її значення серед фундаментальних і прикладних біологічних наук. Наведено новітні принципи зоологічної систематики. Розглянуто значення хордових тварин у підтриманні стійкості та пружності основних типів екосистем; загальні риси, властиві всім хордовим тваринам, обсяг типу Хордових, його систематику, походження та філогенетичні зв’язки головних таксономічних одиниць, специфіку прояву загальнобіологічних законів на прикладі хордових тварин, порівняльні анатомо-морфологічні особливості систем органів і головні риси їхньої еволюції, загальні особливості екології та поширення. Інформацію подано у формі презентацій (Microsoft PowerPoint). Посібник містить зображення з відкритих джерел. Для студентів закладів вищої освіти, які слухають зоологічні курси, та викладачів практичних курсів із зоології хордових.Item Antibacterial properties of zinc oxide-containing composite materials based on silica and polylactic acid(ЛНУ імені Івана Франка, 2025) Bespalko, Oleksandr; Vakuliuk, Polina; Furtat, Iryna; Pryshchepa, Oleksandra; Kozakevych, Roman; Pomastowski, PawełAntimicrobial resistance poses a critical threat to global health, as conventional drugs increasingly fail against multidrug-resistant pathogens. A key challenge lies in the inability of many antimicrobials to penetrate microbial membranes or act effectively against intracellular infections. Nanoparticles (NPs) offer a promising alternative due to their unique physicochemical properties and broad-spectrum antimicrobial activity. Among these, zinc oxide nanoparticles (ZnO NPs) are especially notable for their low cytotoxicity and effectiveness against resistant strains.Item Long non-coding RNA SNHG1 as a diagnostic and prognostic marker of bladder cance(2025) Bratyshchenko, Anastasiia; Haviaz, Volodymyr; Honcharenko, Anton; Stakhovsky, Eduard; Kononenko, Oleksiy; Rosohatska, Inna; Pasichnyk, Tetiana; Mankovska, OksanaBladder cancer (BC) is one of the most prevalent cancers globally, and it ranks as the fifth most common malignancy among men in Ukraine. Modern diagnostic tools for bladder cancer have significant limitations: some of them are overly invasive and others lack sufficient sensitivity and specificity. Currently, molecular markers are becoming a promising tool for identification of oncogenic processes. Among epigenetic mechanisms involved in malignant cell transformation, long non-coding RNA (lncRNA)s are of particular interest, as they can act as either oncogenes or tumor suppressors. Available studies suggest that the lncRNA SNHG1, which is currently understudied, promotes tumor proliferation and inhibits apoptosis in malignant cells. The aim of the current study was to analyze changes in the relative expression of SNHG1 in tumor tissues and its levels in cell-free urine of bladder cancer patients, and to evaluate its diagnostic and prognostic value. There was a statistically significant increase in the SNHG1 gene expression level in tumor tissues compared to conditionally normal tissues. Also, a significant decrease in relative levels of SNHG1 transcripts was observed in urine of BC patients compared to healthy individuals. According to the analysis of ROC curves analysis, the chosen marker can identify bladder cancer with high sensitivity and specificity. A positive correlation was also discovered between SNHG1 expression level in tumor tissue and cancer stage. The obtained data support the relevance of further study on lncRNA SNHG1 as a promising diagnostic and prognostic marker of bladder cancer.Item Association of alpha-synuclein co-pathology with beta-amyloid and phosphorylated tau levels in Alzheimer's disease(2025) Shpylchyn, Vitalii; Vyniavska, PolinaMisfolded α-synuclein (α-syn) aggregates can be present in the cerebrospinal fluid (CSF) of individuals with Alzheimer’s disease (AD), even in the absence of clinical signs of synucleinopathy. This co-pathology may influence AD progression at the molecular level. Detection of α-synuclein aggregates using seed amplification assay (SAA) enables stratification of AD patients beyond classical biomarkers included in the AT(N) framework. The AT(N) framework allows biological classification of AD based on its core pathological processes: β-amyloid aggregation (A), tau accumulation and hyperphosphorylation (T), and non-specific neurodegeneration (N). This study aimed to explore whether α-syn co-pathology, detected by SAA, is associated with altered concentrations and longitudinal trajectories of CSF β-amyloid 42 (Aβ42) and phosphorylated tau 181 (p-tau181) in the biomarker-defined AD group. Data from A+T+ participants (N = 609) in the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) were analysed, using Roche Elecsys electrochemiluminescence immunoassay (ECLIA) and SAA results. Substantial discrepancies between clinical diagnosis and AT profiles were observed. Twenty-nine percent of A+T+ participants were α-synpositive (S+), indicating a high prevalence of α-syn co-pathology in biologically defined AD. Cross-sectional comparisons revealed that S+ individuals had lower baseline Aβ42 concentrations compared to α-synnegative (S−) participants. Linear mixed-effects models (LMEMs) showed a significantly steeper decline in Aβ42 over time in the S+ group, supporting the hypothesis that misfolded α-syn aggregation accelerates amyloid aggregation. However, p-tau181 levels increased more slowly in S+ than in S− individuals, contrary to expectations. These associations remained significant after adjustment for age, sex, diagnosis, and APOE-ε4 genotype. These findings suggest that α-syn co-pathology may affect AD progression through its interaction with Aβ42 and support its integration into biomarker-based classification frameworks.Item Colibacillosis in broiler chicks and its etiological link to the biological characteristics of Escherichia coli isolates from the breeder flock(2025) Nechypurenko, Oleksii; Furtat, Iryna; Dreval, Denis; Avdeeva, LiliyaPathogenic strains of Escherichia coli, capable of causing avian colibacillosis (APEC), currently pose a significant threat to modern poultry farming, in particular industrial broiler production. Moreover, the origin of colibacillosis in broiler chickens is connected with parental health issues. Therefore, the aim of the work was to investigate the etiological link between colibacillosis in 1-day old chicks and the biological characteristics of E. coli isolates from the breeder flock. A total of 65 pathogenic E. coli isolates were detected from broiler-breeders (n = 14) and 1-day-old chikens (n = 51). This shows a huge impact of collibacillosis on poultry farming at different levels of production. The main lesions were associated with fibrin deposition and omphlaitis formation. The last-mentioned parameter could affect the viability of chicks; nevertheless, the average Pasgar score was identified as 9.7 points. Amomg APEC, the most prevalent were O78 and O18 serotypes, wich were characterized by the absence of β-hemolysis. Moreover, the antibiotic profile of APEC isolated from parenteral and progeny flocks was similar. A high level of resistance to amoxicillin, amoxiclav, doxycycline, tetracycline, and enrofloxacin was found; more than 70% of isolated APEC were invulnerable to the mentioned antimicrobials. The most effective antibiotics were colistin, gentamicin, and florfenicol, to which only 0.0% and 2.0%, 14.3 and 9.8%, 7.1% and 2.0% of isolated APEC from broiler-breeders and chickens, respectively, were resistant. In addition, prolonged treatment of birds led to the formation of multi-resistant strains that affected chickens from the first days of life. Thus, studying the process of APEC infection through an integrated production chain can be useful for taking appropriate measures to prevent early cases of colibacilosis.Item Silica-based Spheres Enriched with Sulfur- and Nitrogen-containing Groups: Transitioning from Adsorbents to Sensory Applications(2024) Stoliarchuk, Nataliia; Tomina, Veronika; Kyshkarova, Viktoriia; Furtat, Iryna; Semeshko, Olha; Seisenbaeva, Gulaim; Melnyk, InnaThe chemical properties at the surface of silica-based materials play a pivotal role in their application effectiveness. The characteristics, positioning, and mixture of surface functional groups directly influence the adsorption properties of these materials. Through a singular synthesis process, it’s possible to create functionalized silica spheres, paving the way for the development of sorbents that are highly efficient in cleaning wastewater from the metallurgy and textile industries or in the precise extraction of precious metals from discarded electronic components.Item Мінливість послідовностей низки генів Pm у представників TRITICEAE(2024) Плигун, Вікторія; Антонюк, МаксимМета. Співставлення послідовностей відібраних генів стійкості, розміщених у GenBank, для пошуку типів відмінностей у їхньому нуклеотидному складі та визначення значущості цих відмінностей при створенні праймерів. Методи. Пошук послідовностей проводили у біологічній базі даних GenBank. Порівняння різних сиквенсів одного і того ж гену здійснювали у DnaSP6 через розрахунок критерію Тадзіми для Pm2, Pm3 та критерію Колмогорова-Смірнова у GeneDoc для Pm21. Множинне вирівнювання зробили у CLUSTALW перед тим як працювати у зазначених програмах. Розробляли праймери у Primer3. Результати. Варіабельність порівнюваних послідовностей є у нуклеотидних замінах, інсерціях / делеціях, наявності транспозону в одній з послідовностей Pm3. Найбільш варіабельними є ділянки, які кодують повтори, багаті на лейцин. Послідовності, ізольовані з Triticum dicoccoides, мають дві такі ділянки, в межах кожної деякі зі змін у нуклеотидній послідовності відображатимуться на амінокислотному складі білків. Висновки. Відмінності між порівнюваними послідовностями Pm2, Pm3, Pm21 (у межах кожного з генів) є випадковими (р < 0,05). За результатами вивчення сиквенсів створені комбінації праймерів для ідентифікації послідовностей, характерних для генів стійкості, на доступному рослинному матеріалі.Item Гуанідинійвмісні аліфатичні олігомери з бактерицидною активністю(Інститут хімії високомолекулярних сполук НАН України, 2024) Вортман, Марина; Фуртат, Ірина; Вакулюк, Поліна; Лемешко, Валентина; Пилипенко, Андрій; Шевченко, ВалерійРозроблено метод синтезу реакційноздатних аліфатичних гідрохлоридних гуанідинієвих олігомерів (ГО) різної ММ реакцією олігомерного оксіалкілаліфатичного діепоксиду з гуанідином за змінного співвідношення вихідних компонентів з подальшою нейтралізацією отриманого продукту соляною кислотою. Синтезовані олігомери являють собою дифільні біанкерні поверхнево-активні речовини з жорсткими гуанідиновими фрагментами на кінцях ланцюга. Характерною особливістю будови ГО є їхня амфіфільність, спричинена наявністю гідроксивмісних гуанідинієвих фрагментів як на кінцях, так і всередині ланцюга. Хімічну будову ГО охарактеризовано методами ІЧ-, 1Н-ЯМР спектроскопії. Досліджено бактерицидні властивості аліфатичних гуанідинієвих олігомерів щодо низки грампозитивних і грамнегативних бактерій залежно від ММ ГО. Визначено мінімальну пригнічувальну концентрацію аліфатичних гуанідинієвих олігомерів щодо досліджуваних штамів бактерій. Показано, що найбільшу бактерицидну активність і, відповідно, найменшу мінімальну пригнічувальну концентрацію щодо грампозитивних і грамнегативних бактерій має олігомер з низькою ММ. Крім того, притаманна синтезованим ГО реакційна здатність робить їх перспективними реагентами для отримання нових типів полімерів і композиційних матеріалів на їх основі.Item Concept of Teaching Academic Biosecurity and Biosafety Disciplines as a Countermeasure to the Main Challenges Under the Conditions of Disinformation War Against Ukraine(2022) Furtat, IrynaDisinformation spreading as part of the hybrid war concept is one of the characteristic features of the modern Russia-Ukraine war. Its peculiarity is that the aggressor country uses various actors and information technologies to defeat its opponents both in the absence of direct armed conflict and during active actions.Item Формування стійкості до патогенів у рослин за участі епігенетичних чинників і фітогормонів(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2023) Плигун, Вікторія; Антонюк, МаксимУ статті розглянуто особливості стійкості рослин до патогенів, яка визначається наявністю генів резистентності та регуляцією їхньої активності за допомогою фітогормонів, діяльності ядерного порового комплексу, через епігенетичні модифікації на посттранскрипційному та посттрансляційному рівні ДНК і гістонів, відповідно. Охарактеризовано ядерний поровий комплекс, який складається з нуклеопоринів, ядерного порового кошика, цитоплазматичних філаментів і має здатність вибірково транспортувати транскрипційні фактори до ядра з цитоплазми та мРНК у протилежному напрямку, впливаючи на експресію генів. Серед епігенетичних модифікацій, описаних у статті, найбільш поширеним та охарактеризованим є метилювання (описано для ДНК і гістонів), яке забезпечує стабільність геному, доступність транскрипційних факторів. Зазначено, що для гістонів додавання метильної групи до амінокислотних залишків не завжди є чинником замовчування генів, оскільки вирішальними є кількість доданих груп і те, до якої амінокислоти вони приєднані. Обговорено перехід до транскрипційної активності генів завдяки ацетилюванню гістонів. Ацетилтрансфераза гістонів загального контролю TaGCN5 здатна сприяти експресії гена еноїл-КоА-редуктази в аллогексаплоїдної пшениці, яка задіяна в біосинтезі кутикулярного воску як одного з чинників захисту. Зворотний процес деацетилювання є як позитивним регулятором через зв’язки з факторами відповіді на етилен, так і негативним, оскільки перешкоджає ацетилюванню та метилюванню амінокислот гістонів. Також наведено інформацію про вплив, крім етилену, жасмонової та саліцилової кислот, комбінації перелічених фітогормонів на формування системної набутої резистентності. Позитивним фітогормоном для патогенів є ауксин через його здатність впливати на структуру клітинної стінки. Однак патогени завдяки ефекторам здатні інгібувати імунні відповіді рослини, тому спостерігається постійна «гонка озброєнь» із добором більш ефективних засобів проникнення й розвитку в рослині та її захисних реакцій. Наголошено на важливості й актуальності вивчення шляхів формування стійкості та аспектів, які даватимуть розуміння про визначальні чинники резистентності – наявність послідовності гена та/або факторів, які регулюють її експресію.Item Моніторинг флористичного різноманіття урочища Теремки НПП "Голосіївський" в умовах антропогенного навантаження(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2023) Вишенська, Ірина; Крамаренко, Андрій; Травінська, АнастасіяУ статті наведено результати моніторингу флористичного різноманіття урочища Теремки, що як відокремлена територія входить до складу НПП "Голосіївський". Урочище безпосередньо прилягає до великого житлового масиву і двох автомагістралей. Проведено аналіз основних чинників впливу на екологічний стан території. Доведено необхідність постійного моніторингу екологічного стану природних біотопів, розташованих у межах сучасних мегаполісів. Продемонстровано, що саме моніторинг флористичного різноманіття, контроль збереження цінних і раритетних видів рослин, поява і поширення інвазійних чужорідних видів можуть бути ефективними показниками екологічного стану природного біотопу. Такий моніторинг можна здійснювати як за допомогою польових спостережень, так і з використанням дистанційних методів та аналізу глобальних баз біорізноманіття.Item Роль математичної моделі функціонування кровотвірної системи у поясненні процесів репарації гемопоезу після збурюючого впливу іонізуючої радіації(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2012) Бойко, Роман; Білько, Денис; Борбуляк, Ірина; Дупленко, Юрій; Білько, НадіяНа основі описаної раніше математичної моделі кровотворення [1] проаналізовано процеси, які відбуваються у гемопоетичній системі у нормі та у випадку дії іонізуючої радіації. З’ясовано залежності між параметрами математичної моделі і середнім числом клітин в однорідній популяції та середньою кількістю клітин у певні періоди клітинного циклу. Отримані результати розширюють уявлення про процеси репарації у кровотвірній системі в разі дії іонізуючої радіації та можуть бути застосовані для оцінювання часових цитологічних параметрів проліферації кровотвірних клітин-попередників.Item Математична модель функціонування системи кровотворення(Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2010) Бойко, Роман; Білько, Надія; Білько, ДенисАвторами статті було зроблено спробу проаналізувати кровотворення як стаціонарний процес проліферації і диференціювання кровотворних клітин і, використовуючи закономірності тих чи тих його етапів, перетворити їх на математичні формули. Отримані результати, підтверджені експериментально, можуть у подальшому слугувати основою для розрахунків числових показників популяцій клітин, необхідних для відновлення гемопоезу.Item Analysis of Arabidopsis non-reference accessions reveals high diversity of metabolic gene clusters and discovers new candidate cluster members(2023) Marszalek-Zenczak, Malgorzata; Satyr, Anastasiia; Wojciechowski, Pawel; Zenczak, Michal; Sobieszczanska, Paula; Brzezinski, Krzysztof; Iefimenko, Tetiana; Figlerowicz, Marek; Zmienko, AgnieszkaMetabolic gene clusters (MGCs) are groups of genes involved in a common biosynthetic pathway. They are frequently formed in dynamic chromosomal regions, which may lead to intraspecies variation and cause phenotypic diversity. We examined copy number variations (CNVs) in four Arabidopsis thaliana MGCs in over one thousand accessions with experimental and bioinformatic approaches. Tirucalladienol and marneral gene clusters showed little variation, and the latter was fixed in the population. Thalianol and especially arabidiol/baruol gene clusters displayed substantial diversity. The compact version of the thalianol gene cluster was predominant and more conserved than the noncontiguous version. In the arabidiol/baruol cluster, we found a large genomic insertion containing divergent duplicates of the CYP705A2 and BARS1 genes. The BARS1 paralog, which we named BARS2, encoded a novel oxidosqualene synthase. The expression of the entire arabidiol/baruol gene cluster was altered in the accessions with the duplication. Moreover, they presented different root growth dynamics and were associated with warmer climates compared to the reference-like accessions. In the entire genome, paired genes encoding terpene synthases and cytochrome P450 oxidases were more variable than their nonpaired counterparts. Our study highlights the role of dynamically evolving MGCs in plant adaptation and phenotypic diversity.