Структурно-биологическая характеристика изотипов СК1-подобных протеинкиназ, непосредственно связанных с регуляцией системы микротрубочек высших растений

Simple item page
dc.contributor.authorКарпов, П.
dc.contributor.authorРаевский, А.
dc.contributor.authorШеремет, Я.
dc.contributor.authorЕмец, Алла
dc.contributor.authorБлюм, Ярослав
dc.date.accessioned2021-02-03T20:48:57Z
dc.date.available2021-02-03T20:48:57Z
dc.date.issued2020
dc.description.abstractИдентифицировано 18 изотипов СК1-подобных протеинкиназ у A. thaliana. Сравнение каталитических доменов протеинкиназ СК1 крысы (a, ft, у 1-3, due) и 18-ти гомологов из A. thaliana подтвердило значительное структурное сходство 13-ти протеинкиназ: CKL1 (CK1S), CKL2, CKL3, CKL4, CKL5, CKL6, CKL7, CKL8, CKL9, CKL10, CKL11, С К Ш и CKL13. Было обнаружено, что СК1 -специфический ингибитор D4476 взаимодействует с KC1D крысы и отобранными растительными гомологами аналогичным АТФ-конкурентным способом. Взаимодействие с лигандом было подтверждено значениями оценочных функций докинга, результатами молекулярной динамики и результатами хемогенного анализа. Известно, что взаимодействие протеинкиназ СК1 с субстратными белками в значительной степени зависит от наличия специфических мотивов, расположенных в С-концевой области. Соответствующие мотивы взаимодействия с ЕВ1 были выявлены в С-концевых областях CKL1 и CKL2. Также была подтверждена роль С-коневого фрагмента CKL6 во взаимодействии с В-тубулином.ru_RU
dc.description.abstractIt was identified 18 isotypes of CKl-like protein kinases in A. thaliana. Comparison of catalytic domains in rat CK1 (a, p, y, 3, 5, and e) and 18 plant homologs from A. thaliana, confirm high structural similarity for 13 CKl-like kinases: CKL1 (CK15), CKL2, CKL3, CKL4, CKL5, CKL6, CKL7, CKL8, CKL9, CKL10, CKL11, CKL12 and CKL13. It was found that CKl-specific inhibitor D4476 interact with rat КС ID and 13 plant homologes in similar ATP-competitive manner. Ligand binding were confirmed by docking scoring functions, molecular dynamics and chemogenomic analysis. The specific binding of CK1 kinases with substrate proteins depend on specific motifs located in their C-end region. The specific motifs of EB1 binding was identified in plant CKL1 and CKL2. Also, it was confirmed the role of C-end region in CKL6-p-tubulin interaction.en_US
dc.description.abstractІдентифіковано 18 ізотипів СК1-подібних протеїнкіназ у A. thaliana. Порівняння каталітичних доменів протеїнкіназ СК1 пацюка (а, р, у 1-3, б і є) і 18-ти гомологів з A. thaliana підтвердило значну структурну подібність у випадку 13-ті протеїнкиназ: CKL1 (СК15), CKL2, CKL3, CKL4, CKL5, CKL6, CKL7, CKL8, CKL9, CKL10, CKL11, CKLI2 і CKL13. Було встановлено, що СК1-специфічний інгібітор D4476 взаємодіє з KC1D пацюка і відібраними рослинними гомологами у аналогічної АТФ-конкурентної манери. Взаємодію з лігандом було підтверджено значеннями оціночних функцій докінгу, результатами молекулярної динаміки і результатами хемогенного аналізу. Відомо, що взаємодія протеїнкіназ СК1 з субстратними білками в значній мірі залежить від наявності специфічних мотивів, розташованих в С-кінцевий ділянці. Відповідні мотиви що відповідають за взаємодію з ЕВ1, були знайдені в С-кінцевих ділянках CKL1 і CKL2. Також була підтверджена роль С-кінцевого фрагмента CKL6 у взаємодії з р-тубуліном.uk_UA
dc.identifier.citationСтруктурно-биологическая характеристика изотипов СК1-подобных протеинкиназ, непосредственно связанных с регуляцией системы микротрубочек высших растений / П. А. Карпов, А. В. Раевский, Я. А. Шеремет, А. И. Емец, Я. Б. Блюм // Цитологія і генетика. - 2020. - Т. 54, № 4. - С. 15-29.ru_RU
dc.identifier.urihttps://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/19398
dc.language.isoruuk_UA
dc.relation.sourceЦитологія і генетика.uk_UA
dc.statusfirst publisheduk_UA
dc.subjectказеин киназа 1ru_RU
dc.subjectрастительные гомологиru_RU
dc.subjectтубулинru_RU
dc.subjectЕВ1ru_RU
dc.subjectфосфорилированиеru_RU
dc.subjectингибиторru_RU
dc.subjectD4476ru_RU
dc.subjectArabidopsisru_RU
dc.subjectстатьяru_RU
dc.titleСтруктурно-биологическая характеристика изотипов СК1-подобных протеинкиназ, непосредственно связанных с регуляцией системы микротрубочек высших растенийru_RU
dc.title.alternativeStructural pattern of CK1-like protein kinases associated with regulation of plant microtubule cytoskeletonen_US
dc.title.alternativeСтруктурно-біологічна характеристика ізотипів СК1-подібних протеїнкіназ, які беруть безпосередню участь в регуляції систем мікротрубочок вищих рослинuk_UA
dc.typeArticleuk_UA
Files
Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
Strukturno-biologicheskaya_kharakteristika_izotipov.pdf
Size:
1.43 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Download
License bundle
Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
7.54 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description:
Download
Collections
Кафедра лабораторної діагностики біологічних систем