Кафедра біології

Permanent URI for this collection

https://ekmair.ukma.edu.ua/handle/123456789/12295

Browse

Browsing Кафедра біології by Author "Плигун, Вікторія"

Now showing 1 - 2 of 2
  • Thumbnail Image
    Item
    Мінливість послідовностей низки генів Pm у представників TRITICEAE
    (2024) Плигун, Вікторія; Антонюк, Максим
    Мета. Співставлення послідовностей відібраних генів стійкості, розміщених у GenBank, для пошуку типів відмінностей у їхньому нуклеотидному складі та визначення значущості цих відмінностей при створенні праймерів. Методи. Пошук послідовностей проводили у біологічній базі даних GenBank. Порівняння різних сиквенсів одного і того ж гену здійснювали у DnaSP6 через розрахунок критерію Тадзіми для Pm2, Pm3 та критерію Колмогорова-Смірнова у GeneDoc для Pm21. Множинне вирівнювання зробили у CLUSTALW перед тим як працювати у зазначених програмах. Розробляли праймери у Primer3. Результати. Варіабельність порівнюваних послідовностей є у нуклеотидних замінах, інсерціях / делеціях, наявності транспозону в одній з послідовностей Pm3. Найбільш варіабельними є ділянки, які кодують повтори, багаті на лейцин. Послідовності, ізольовані з Triticum dicoccoides, мають дві такі ділянки, в межах кожної деякі зі змін у нуклеотидній послідовності відображатимуться на амінокислотному складі білків. Висновки. Відмінності між порівнюваними послідовностями Pm2, Pm3, Pm21 (у межах кожного з генів) є випадковими (р < 0,05). За результатами вивчення сиквенсів створені комбінації праймерів для ідентифікації послідовностей, характерних для генів стійкості, на доступному рослинному матеріалі.
  • Thumbnail Image
    Item
    Формування стійкості до патогенів у рослин за участі епігенетичних чинників і фітогормонів
    (Національний університет "Києво-Могилянська академія", 2023) Плигун, Вікторія; Антонюк, Максим
    У статті розглянуто особливості стійкості рослин до патогенів, яка визначається наявністю генів резистентності та регуляцією їхньої активності за допомогою фітогормонів, діяльності ядерного порового комплексу, через епігенетичні модифікації на посттранскрипційному та посттрансляційному рівні ДНК і гістонів, відповідно. Охарактеризовано ядерний поровий комплекс, який складається з нуклеопоринів, ядерного порового кошика, цитоплазматичних філаментів і має здатність вибірково транспортувати транскрипційні фактори до ядра з цитоплазми та мРНК у протилежному напрямку, впливаючи на експресію генів. Серед епігенетичних модифікацій, описаних у статті, найбільш поширеним та охарактеризованим є метилювання (описано для ДНК і гістонів), яке забезпечує стабільність геному, доступність транскрипційних факторів. Зазначено, що для гістонів додавання метильної групи до амінокислотних залишків не завжди є чинником замовчування генів, оскільки вирішальними є кількість доданих груп і те, до якої амінокислоти вони приєднані. Обговорено перехід до транскрипційної активності генів завдяки ацетилюванню гістонів. Ацетилтрансфераза гістонів загального контролю TaGCN5 здатна сприяти експресії гена еноїл-КоА-редуктази в аллогексаплоїдної пшениці, яка задіяна в біосинтезі кутикулярного воску як одного з чинників захисту. Зворотний процес деацетилювання є як позитивним регулятором через зв’язки з факторами відповіді на етилен, так і негативним, оскільки перешкоджає ацетилюванню та метилюванню амінокислот гістонів. Також наведено інформацію про вплив, крім етилену, жасмонової та саліцилової кислот, комбінації перелічених фітогормонів на формування системної набутої резистентності. Позитивним фітогормоном для патогенів є ауксин через його здатність впливати на структуру клітинної стінки. Однак патогени завдяки ефекторам здатні інгібувати імунні відповіді рослини, тому спостерігається постійна «гонка озброєнь» із добором більш ефективних засобів проникнення й розвитку в рослині та її захисних реакцій. Наголошено на важливості й актуальності вивчення шляхів формування стійкості та аспектів, які даватимуть розуміння про визначальні чинники резистентності – наявність послідовності гена та/або факторів, які регулюють її експресію.